グラフ機械学習と強化学習について

主にグラフ機械学習や強化学習手法を記載します。

グラフ理論

ECFPとNeural-fingerprintの比較

はじめに ケモインフォマティクスやマテリアルズインフォマティクスでは良く使用されるExtended Connectivity Circular Fingerprints (ECFP)及び Neural Graph Fingerprint (NFP) を実装してみました。ZincデータセットのlogP-SAを予測することで、両手法を…

Junction Treeアルゴリズム

ベイジアンネットワークの推論では良く用いられるアルゴリズムです。分子構造もグラフ構造なので本アルゴリズムは適用することができます。グラフを木分解(tree decomposition)することで得られる構造がjunction treeです。有向グラフの場合、無向グラフに…